من المدارس الدينية الرائدة في النجف الاشرف وهي جامعة النجف الدينية والمعروفة بجامعة كلانتر وهي صرح ديني علمي ومعماري شاخص في هذه المدينة المقدسة وتقع هذه الجامعة في حي السعد ومباشرة على شارع نجف كوفة، تعود فكرة انشائها للسيد محمد بن السيد سلطان الموسوي المشهور بالسيد محمد كلانتر وهو مؤسسها وعميدها رحمه الله حيث اسست سنة 1376هـ وشرع العمل ببناءها واستمر العمل بها لغاية سنة 1382هـ إذ افتتحت ليلة مبعث الرسول الاكرم صلى الله عليه واله السابع والعشرين من رجب الاصب 1382هـ

تعدُّ جامعة النجف الدينية (جامعة كلانتر) من اكبر مدراس النجف الدينية وتعتمد هذه الجامعة الدينية على نظام داخلي خاص وهو مطبوع مع الوقفية على شكل كراس باسم (وقفية جامعة النجف الدينية مع نظامها الداخلي) وفيه نظام رائع ينبع من الشعور بالمسؤولية الدينية والرجاء لمرضاة الله.

وازدهرت منذ الافتتاح ولا تزال تزدان برواد العلم والفضيلة حيث يؤمها طلبة العلوم الدينية ومكتسبو الفضائل الانسانية لقد شيدت هذه الجامعة الدينية على ارض مساحتها (5000) متر مربع وهي تحوي على (200) غرفة تقريبا للسكن قائمة على ثلاثة طوابق اضافة الى السرداب وتحوي على مجاميع صحية وحمامات واماكن للطبخ والغسيل، الشكل الخارجي للجامعة جميل جدا حيث يكون المدخل بواجهة نصف دائرية تتوسط المدخل حديقة دائرية باب المدخل للجامعة في الوسط وفي الداخل قاعات الدرس والمناسبات

كما تمتاز الجامعة الدينية بضبط وقت الاذان وكذلك بصوت المؤذن المميز وكما تتميز الجامعة كصرح معماري في مدينة النجف حيث الشكل الهندسي الذي يتصف بالحداثة مع الالتزام بالطابع الديني للمدينة كما ويجذب شكل القبة التي تعلو صرح الجامعة بشكلها القاشاني الجميل للناظر لها من جميع الاتجاهات.

ان الجامعة الدينية لم تسلم من الاذى والقصف خلال الانتفاضة الشعبانية المباركة عام 1991 ميلادية من قبل الجيش الصدامي انذاك ولكن بفضل الله وحمده وعزم ادارة الجامعة تم اعادة اعمارها كبناية وكذلك تم اعادة الدراسة واستمرت بشكل متواصل برفد الحركة المعرفية والدينية برجال العلم والفقه والفضيلة وبكافة بقاع الارض لينشروا معالم الدين الاسلامي وعلوم اهل البيت عليهم السلام.